RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ELP3Q9H9T3 547 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DPP7Q9UHL4 492 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CDC25AP30304 524 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HMGCS2P54868 508 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CD302Q8IX05 232 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RFFLQ8WZ73 363 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RAPGEF5Q92565 580 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MROH8Q9H579 483 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SELENONQ9NZV5 590 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 P4HA2O15460 535 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RPS6KA5O75582 802 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RGS2P41220 211 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GPS1Q13098 491 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RASA4BC9J798 803 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RASA4O43374 803 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PRKCQQ04759 706 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RBBP7Q16576 425 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 UGP2Q16851 508 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MFN1Q8IWA4 741 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RIT2Q99578 217 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DSEQ9UL01 958 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 BNIP3LO60238 219 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 APOA4P06727 396 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SLC2A3P11169 496 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ODC1P11926 461 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TMPRSS15P98073 1019 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K10Q02779 954 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 IFT88Q13099 833 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GPR182O15218 404 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PDHBP11177 359 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DFFAO00273 331 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RGL2O15211 777 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EXTL3O43909 919 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ACSL3O95573 720 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CSF1RP07333 972 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 IFNAR2P48551 515 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF394Q53GI3 561 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KRT80Q6KB66 452 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0G2JLW4 131 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CAMTA2O94983 1202 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SESN3P58005 492 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB9Q96C00 473 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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