RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PLCG1P19174 1290 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC25AP30304 524 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GRM5P41594 1212 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ME1P48163 572 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GLUD2P49448 558 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GATMP50440 423 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SCNN1GP51170 649 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC12A3P55017 1021 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT85P78386 507 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 COL19A1Q14993 1142 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LONRF3Q496Y0 759 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB33Q86T24 672 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TTPALQ9BTX7 342 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBP1Q9H171 429 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 FNIP2Q9P278 1114 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MAFFQ9ULX9 164 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP250Q9BV73 2442 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 USP24Q9UPU5 2620 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087WWV3 80 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 B4GALT5O43286 388 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 XYLBO75191 536 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RECQL4O94761 1208 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GLUD1P00367 558 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MYL1P05976 194 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 AKAP5P24588 427 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ELF1P32519 619 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 IRS1P35568 1242 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NBL1P41271 181 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC11A1P49279 550 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVFC1P60507 584 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 DSC1Q08554 894 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MYO7AQ13402 2215 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MCM6Q14566 821 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 AMHR2Q16671 573 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 UBXN11Q5T124 520 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LIN9Q5TKA1 542 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 APPL2Q8NEU8 664 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 EDAQ92838 391 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNN1Q92952 543 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ACCSQ96QU6 501 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PLIN2Q99541 437 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF39Q9H2S5 420 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TNMDQ9H2S6 317 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM206Q9H813 350 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF19AQ9NV58 838 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SNTG2Q9NY99 539 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 USP25Q9UHP3 1055 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TBX20Q9UMR3 447 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR6Q9Y217 621 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GDAQ9Y2T3 454 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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