RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 STAMQ92783 540 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 UROC1Q96N76 676 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PIDD1Q9HB75 910 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 H0YCG3 227 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 KIF4AO95239 1232 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SPATA31D3P0C874 917 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 MCF2P10911 925 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 MAPK7Q13164 816 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 ACAP3Q96P50 834 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TGM5O43548 720 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TRAPPC3O43617 180 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 B3GAT3O94766 335 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 MYBP10242 640 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SLC12A3P55017 1021 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 OSTNP61366 133 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 FBXL6Q8N531 539 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 CDT1Q9H211 546 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.18■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.17■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 CUL4AQ13619 759 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 NAB2Q15742 525 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PSMD5Q16401 504 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 RTP2Q5QGT7 225 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PRRX2Q99811 253 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.17■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.16■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 LIN9Q5TKA1 542 aa22.16■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.16■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.16■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 RFPL2O75678 378 aa22.15■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 ASGR2P07307 311 aa22.15■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 SCP2P22307 547 aa22.15■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 LILRA6Q6PI73 481 aa22.15■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 ZPBP2Q6X784 338 aa22.15■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 GPBP1Q86WP2 473 aa22.15■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 BICD1Q96G01 975 aa22.15■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.15■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 TRIOO75962 3097 aa22.14■■□□□ 1.14
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DDB1-220ENST00000542337 PROZP22891 400 aa22.14■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 CEP120Q8N960 986 aa22.14■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 CLUHO75153 1309 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ZMYND10O75800 440 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 FAM13AO94988 1023 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 FGFR3P22607 806 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ARSHQ5FYA8 562 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 MYCT1Q8N699 235 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 SNX27Q96L92 541 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 TECTAO75443 2155 aa22.13■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
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