RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532280.1

PTENP1-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 3,996 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-202ENST00000532280 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 MTBPQ96DY7 904 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PPIP5K2O43314 1243 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 KRT80Q6KB66 452 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 GLI3P10071 1580 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ASPHQ12797 758 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 GRIK3Q13003 919 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SLFN13Q68D06 897 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 CENPPQ6IPU0 288 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 LRCH1Q9Y2L9 728 aa15.38■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 DYTNA2CJ06 578 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 INHBAP08476 426 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ITIH3Q06033 890 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 NFIAQ12857 509 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 OLFM3Q96PB7 478 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 CCDC22O60826 627 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PDE5AO76074 875 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RSPH10BP0C881 870 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SPOCK2Q92563 424 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 POLLQ9UGP5 575 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PSMC6P62333 389 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 C2CD6Q53TS8 623 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 MYH10P35580 1976 aa15.37■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 CHRNA3P32297 505 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 C16orf87Q6PH81 154 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 FAM210AQ96ND0 272 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SYT15Q9BQS2 421 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ALG6Q9Y672 507 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 NUP98P52948 1817 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ZBBXA8MT70 800 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 BFSP1Q12934 665 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 MAPK7Q13164 816 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 Q4G0T1 1027 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ANO3Q9BYT9 981 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 Q9H521 79 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ATP2B4P23634 1241 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 USP46P62068 366 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.36■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RARAP10276 462 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 CHADLQ6NUI6 762 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 RFFLQ8WZ73 363 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 PREBQ9HCU5 417 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.35■□□□□ 0.05
PTENP1-202ENST00000532280 USP21Q9UK80 565 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms