RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 HOXC9P31274 260 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MEOX1P50221 254 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SART3Q15020 963 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SPATS1Q496A3 300 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 IL31Q6EBC2 164 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 DGKHQ86XP1 1220 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RTKN2Q8IZC4 609 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MTFR1LQ9H019 292 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TOMM22Q9NS69 142 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MAPRE3Q9UPY8 281 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 NCAPD2Q15021 1401 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 IGSF1Q8N6C5 1336 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF10O15013 1369 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 FAM83GA6ND36 823 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MAN1A1P33908 653 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 EFEMP1Q12805 493 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GFOD2Q3B7J2 385 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TTC38Q5R3I4 469 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 NXNQ6DKJ4 435 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 WDR63Q8IWG1 891 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 KCNH5Q8NCM2 988 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 CHST13Q8NET6 341 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 IP6K1Q92551 441 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MAML3Q96JK9 1138 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 NEUROD6Q96NK8 337 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC37BQ96QE4 947 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 LMF1Q96S06 567 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-214ENST00000530727 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SMPD4Q9NXE4 827 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-214ENST00000530727 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 LMO7Q8WWI1 1683 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-214ENST00000530727 ABCC6O95255 1503 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PRKAR2BP31323 418 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRC-214ENST00000530727 RGS3P49796 1198 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 STAT5BP51692 787 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 NEK3P51956 506 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RAC3P60763 192 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 DSG1Q02413 1049 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 EPHA7Q15375 998 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ERAP2Q6P179 960 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PASD1Q8IV76 773 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 WDR66Q8TBY9 1149 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 CHTF18Q8WVB6 975 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TIFAQ96CG3 184 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 C16orf92Q96LL3 132 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SAMD11Q96NU1 681 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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PTPRC-214ENST00000530727 HMOX1P09601 288 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SCNN1BP51168 640 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 STRN3Q13033 797 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PCOLCEQ15113 449 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RNF151Q2KHN1 245 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PDILTQ8N807 584 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 C7orf31Q8N865 590 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.99□□□□□ -1.61
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