RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 OR7D4Q8NG98 312 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 BCO1Q9HAY6 547 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 EDARQ9UNE0 448 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ZEB2O60315 1214 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ECHS1P30084 290 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 DRC7Q8IY82 874 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 GPR156Q8NFN8 814 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 NELL1Q92832 810 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 TTC1Q99614 292 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 NEMP1O14524 444 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 FDXRP22570 491 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RAP2BP61225 183 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 SP140Q13342 867 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RSAD1Q9HA92 442 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ID4P47928 161 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MAST3O60307 1309 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ENPP3O14638 875 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ELANEP08246 267 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G5P39877 138 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MPLP40238 635 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZVL8 140 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MED25Q71SY5 747 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 CAGE1Q8TC20 777 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 TSPEARQ8WU66 669 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 TLK1Q9UKI8 766 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.8□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MTHFD2P13995 350 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 IL2RBP14784 551 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 PER3P56645 1201 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 SCAPQ12770 1279 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ADRM1Q16186 407 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 COLEC12Q5KU26 742 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 AFMIDQ63HM1 303 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 GPR149Q86SP6 731 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RNF180Q86T96 592 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 FATE1Q969F0 183 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MRI1Q9BV20 369 aa6.79□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GTW7 788 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RAP2AP10114 183 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 SREBF1P36956 1147 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 OCA2Q04671 838 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 STRN3Q13033 797 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MUM1Q2TAK8 710 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RNF31Q96EP0 1072 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 Q96MF0 132 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 DUSP26Q9BV47 211 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 GREM2Q9H772 168 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 LANCL2Q9NS86 450 aa6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SGCE-211ENST00000522045 POMCP01189 267 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ATP5JP18859 108 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 PTH2RP49190 550 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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