RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 MOCS1Q9NZB8 636 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXJ2Q9P0K8 574 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A1B0GTW7 788 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 KDM1AO60341 852 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 KPNA6O60684 536 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1QL1O75973 258 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MATN4O95460 622 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASMTLO95671 621 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL2RBP14784 551 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CXADRP78310 365 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXR2Q6PJQ5 311 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 LNX2Q8N448 690 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR7D4Q8NG98 312 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR2W6PQ8NHA6 318 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF31Q96EP0 1072 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CEP95Q96GE4 821 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAX2Q96IS3 184 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACAP3Q96P50 834 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MED15Q96RN5 788 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 NEU1Q99519 415 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 TIMP4Q99727 224 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTFR1LQ9H019 292 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 IKBKBO14920 756 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 POMCP01189 267 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 GCSHP23434 173 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLA2G5P39877 138 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTH2RP49190 550 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 OCA2Q04671 838 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFSD14BQ5SR56 506 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 RASSF3Q86WH2 238 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPANK1O95872 356 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ELANEP08246 267 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALAS1P13196 640 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ECHS1P30084 290 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPN7P35236 360 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ABCG1P45844 678 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF81P51508 661 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 VAV2P52735 878 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 TSHZ3Q63HK5 1081 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 HOMER1Q86YM7 354 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 NXPE1Q8N323 547 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 HASPINQ8TF76 798 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 NINJ1Q92982 152 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 SARAFQ96BY9 339 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 FEZ1Q99689 392 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLK15Q9H2R5 256 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF7Q9UBF6 113 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 PEX1O43933 1283 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTHFD2P13995 350 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPD1P21695 349 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 FGFR4P22455 802 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOLR3P41439 243 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL2P60568 153 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP2A13Q16696 494 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANO4Q32M45 955 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms