RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 K7ERI5 159 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 ADAM12O43184 909 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 ST18O60284 1047 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CFHP08603 1231 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 LAMP2P13473 410 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 AOC1P19801 751 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 SLC44A3Q8N4M1 653 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.62■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CCDC169A6NNP5 214 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PP2D1A8MPX8 630 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 E9PMD0 336 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 NXPE3Q969Y0 559 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 RAB34Q9BZG1 259 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 WNT16Q9UBV4 365 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 STK24Q9Y6E0 443 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CACNA1HO95180 2353 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 B3GAT3O94766 335 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 C8AP07357 584 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CDC25AP30304 524 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 NPTX2P47972 431 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CLCNKBP51801 687 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PEX3P56589 373 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 IL17AQ16552 155 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 LIN9Q5TKA1 542 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PDXDC1Q6P996 788 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 DNM3Q9UQ16 869 aa18.6■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 KRBA1A5PL33 1030 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PROB1E7EW31 1015 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 HIP1RO75146 1068 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 SRFP11831 508 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 FGFR3P22607 806 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 FSHRP23945 695 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 NBL1P41271 181 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 NTHL1P78549 312 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 KRT79Q5XKE5 535 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 DAW1Q8N136 415 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CEP120Q8N960 986 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CA14Q9ULX7 337 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 DOCK8Q8NF50 2099 aa18.59■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.58■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 ANHXE9PGG2 379 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 STK25O00506 426 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 LAD1O00515 517 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 CCL16O15467 120 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 OR1D2P34982 312 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 OSTNP61366 133 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 HTR4Q13639 388 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 RAB33AQ14088 237 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 UPP1Q16831 310 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 C8orf34Q49A92 452 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 RINT1Q6NUQ1 792 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 CD300LGQ6UXG3 332 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 CDT1Q9H211 546 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 TMEM134Q9H6X4 195 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PTPRHQ9HD43 1115 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 POLIQ9UNA4 740 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 NUMBLQ9Y6R0 609 aa18.58■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 I3L4J1 428 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 TKTP29401 623 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PRPHP41219 470 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 GRM5P41594 1212 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 BRCC3P46736 316 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 MAPK7Q13164 816 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 C1orf186Q6ZWK4 172 aa18.57■□□□□ 0.56
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