RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA32Q96LK8 384 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 TNMDQ9H2S6 317 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 PANK4Q9NVE7 773 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 MARCH5Q9NX47 278 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 C2CD2LO14523 706 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 CLTAP09496 248 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 COASYQ13057 564 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN14Q15678 1187 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 FUT10Q6P4F1 479 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 SHC4Q6S5L8 630 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC1BQ9P126 229 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A087X0B3 334 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 IL9P15248 144 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 CREMQ03060 361 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 RABGGTAQ92696 567 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-210ENST00000505941 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ABLIM1O14639 778 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 MBTPS2O43462 519 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAPPC3O43617 180 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GCNT3O95395 438 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GLP2RO95838 553 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PIGRP01833 764 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ALCAMQ13740 583 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX27Q96L92 541 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 DPP7Q9UHL4 492 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 OGTO15294 1046 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 B3GAT3O94766 335 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ADH1AP07327 375 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNE1P15382 129 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 POSTNQ15063 836 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 XKR4Q5GH76 650 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RESP18Q5W5W9 173 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CES5AQ6NT32 575 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PDXDC1Q6P996 788 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR65Q8IYL9 337 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SYCP3Q8IZU3 236 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 STAMQ92783 540 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL5Q96PQ7 755 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 ACCSQ96QU6 501 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 OLFML3Q9NRN5 406 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 DZANK1Q9NVP4 752 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 NUCB2P80303 420 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 DSG1Q02413 1049 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNC3Q14003 757 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 E2F4Q16254 413 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SEZ6Q53EL9 994 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP57Q86XR8 500 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-210ENST00000505941 HASPINQ8TF76 798 aa22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms