RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-204ENST00000504458 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NENFQ9UMX5 172 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 USTQ9Y2C2 406 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.7□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 MYH10P35580 1976 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 A0A087X0T9 212 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ZEB2O60315 1214 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 KIF4AO95239 1232 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 H2AFZP0C0S5 128 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 FAM228BP0C875 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 MYBL2P10244 700 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 BMP3P12645 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 UCHL3P15374 230 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 KLRC1P26715 233 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 PON1P27169 355 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 STAT1P42224 750 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 TM4SF4P48230 202 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ZNF131P52739 623 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 GYS2P54840 703 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 JAM2P57087 298 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ICA1Q05084 483 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 PPP2R5CQ13362 524 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ALCAMQ13740 583 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 TCEAL1Q15170 157 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 PPP2R5AQ15172 486 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 EPHA7Q15375 998 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 RPS6KA1Q15418 735 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 PRR16Q569H4 304 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 DACT2Q5SW24 774 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 LRRC31Q6UY01 552 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 H2AFVQ71UI9 128 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 IQCKQ8N0W5 287 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 USP38Q8NB14 1042 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SCFD2Q8WU76 684 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SPAG5Q96R06 1193 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ISCUQ9H1K1 167 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 DNAJC18Q9H819 358 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NAGPAQ9UK23 515 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 VAV3Q9UKW4 847 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SIPA1L1O43166 1804 aa6.69□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 F8W031 263 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 H0YGN5 161 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 MYO1CO00159 1063 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 PMM2O15305 246 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 MSH4O15457 936 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 P4HA2O15460 535 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 LILRB5O75023 590 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NDUFB10O96000 172 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ALBP02768 609 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NR3C1P04150 777 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 COL8A1P27658 744 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ATP2B2Q01814 1243 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 PDE4CQ08493 712 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 NFIAQ12857 509 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 MTMR3Q13615 1198 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ARHGEF6Q15052 776 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 CFAP58Q5T655 872 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 SFR1Q86XK3 245 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.68□□□□□ -1.34
SERF1A-204ENST00000504458 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms