RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 RAP2AP10114 183 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 MGAT2Q10469 447 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 MKS1Q9NXB0 559 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 DNM3Q9UQ16 869 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 TRIM75PA6NK02 468 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 RHOBTB3O94955 611 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ALAS1P13196 640 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ATP5JP18859 108 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 AGXTP21549 392 aa6.28□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.28□□□□□ -1.4
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RBM39-241ENST00000496183 CEP95Q96GE4 821 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-241ENST00000496183 ARHGEF11O15085 1522 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 A0A087X1B8 175 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ADCY6O43306 1168 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 POMCP01189 267 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SREBF1P36956 1147 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 GUCY2FP51841 1108 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RAP2BP61225 183 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.27□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 RNF169Q8NCN4 708 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CHFRQ96EP1 664 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CEP89Q96ST8 783 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.27□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 CREMQ03060 361 aa6.26□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 ITKQ08881 620 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ACAP2Q15057 778 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.26□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 Q6ZVL8 140 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 REPS2Q8NFH8 660 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.415e-11■■■□□ 15.1
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RBM39-241ENST00000496183 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 SUV39H1O43463 412 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 B3GALT2O43825 422 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 BMPR1AP36894 532 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 AVPR1BP47901 424 aa6.25□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.25□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 GUCY1A2P33402 732 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 USP14P54578 494 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 GUCY1B3Q02153 619 aa6.24□□□□□ -1.41
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RBM39-241ENST00000496183 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 LCORLQ8N3X6 602 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.24□□□□□ -1.41
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