RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 TTPALQ9BTX7 342 aa14.97□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 KCNH6Q9H252 994 aa14.97□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.97□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.97□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 SLC16A4O15374 487 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 EDN1P05305 212 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 MCF2P10911 925 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 PLS3P13797 630 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 GRM5P41594 1212 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 MAPK7Q13164 816 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 CUL4AQ13619 759 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 CEP57Q86XR8 500 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 PALB2Q86YC2 1186 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 HASPINQ8TF76 798 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 STAMQ92783 540 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 B3GALT6Q96L58 329 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.96□□□□□ -0.01
ABCD4-217ENST00000496015 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SFI1A8K8P3 1242 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TRAPPC3O43617 180 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 B3GAT3O94766 335 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 KIF4AO95239 1232 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SCP2P22307 547 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SLC12A3P55017 1021 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ACAP3Q96P50 834 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CDT1Q9H211 546 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PIDD1Q9HB75 910 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TGM5O43548 720 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TOM1L1O75674 476 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SPATA31D3P0C874 917 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 OSTNP61366 133 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 NAB2Q15742 525 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 RTP2Q5QGT7 225 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 BRD1O95696 1058 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PROZP22891 400 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CLCNKBP51801 687 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PSMD5Q16401 504 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 LIN9Q5TKA1 542 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ZPBP2Q6X784 338 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 GPBP1Q86WP2 473 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 FBXL6Q8N531 539 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 BICD1Q96G01 975 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PRRX2Q99811 253 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PIEZO1Q92508 2521 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 VWA8A3KMH1 1905 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CLDN3O15551 220 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 MYBP10242 640 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ABCD1P33897 745 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 UPP1Q16831 310 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 XKR4Q5GH76 650 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 LILRA6Q6PI73 481 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 MYCT1Q8N699 235 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CEP120Q8N960 986 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms