RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 PRPHP41219 470 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 GLUD2P49448 558 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 CNNM3Q8NE01 707 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 BCO2Q9BYV7 579 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.11■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 E9PMD0 336 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 LAMTOR5O43504 91 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 EDN1P05305 212 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 SCNN1GP51170 649 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 STARD6P59095 220 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 HTR4Q13639 388 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 SLC27A1Q6PCB7 646 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 KCNK18Q7Z418 384 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ZFP42Q96MM3 310 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 GAD1Q99259 594 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 RAB34Q9BZG1 259 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 FZD8Q9H461 694 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 MIOSQ9NXC5 875 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 USP20Q9Y2K6 914 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.1■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 DOCK8Q8NF50 2099 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 A0A1B0GUA9 196 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ARL5CA6NH57 179 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ANHXE9PGG2 379 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PRKCBP05771 671 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 GLULP15104 373 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 LIG1P18858 919 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 AKAP5P24588 427 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 NAMPTP43490 491 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGAP8P85298 464 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 LMNB2Q03252 620 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 CUL4AQ13619 759 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 FAM187BQ17R55 369 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 KRT79Q5XKE5 535 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 STK24Q9Y6E0 443 aa15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CHTF18-212ENST00000493715 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 NR1I2O75469 434 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 C1RP00736 705 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 SPATA31D3P0C874 917 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 OR1G1P47890 313 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 COLGALT2Q8IYK4 626 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 DAW1Q8N136 415 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 DEPTORQ8TB45 409 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 PDZD7Q9H5P4 517 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 MARCH5Q9NX47 278 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 DNM3Q9UQ16 869 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.08■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 F8W810 466 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 LRRN2O75325 713 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 PAPLNO95428 1278 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 MAGEA9P43362 315 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 DSG1Q02413 1049 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 DSC1Q08554 894 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 PPP2R5AQ15172 486 aa15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CHTF18-212ENST00000493715 MAPK6Q16659 721 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms