RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 BCO1Q9HAY6 547 aa6.1□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.1□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.1□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.1□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 HLA-DOAP06340 250 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 HKR1P10072 659 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 SREBF1P36956 1147 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 IL12RB1P42701 662 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 AVPR1BP47901 424 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 SCAND1P57086 179 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 PPP3CAQ08209 521 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 SCAPQ12770 1279 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 CCDC142Q17RM4 750 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 MUM1Q2TAK8 710 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 AFMIDQ63HM1 303 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 MED25Q71SY5 747 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 COQ10AQ96MF6 247 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 LDAHQ9H6V9 325 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.09□□□□□ -1.43
SSB-211ENST00000490914 CCDC78A2IDD5 438 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ITGAMP11215 1152 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 LMO1P25800 156 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ECHS1P30084 290 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 TOR2AQ5JU69 321 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 STON2Q8WXE9 905 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ORAI2Q96SN7 254 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MRI1Q9BV20 369 aa6.08□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 CDKL5O76039 1030 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 RAP2AP10114 183 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 PTH2RP49190 550 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SP140Q13342 867 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 FATE1Q969F0 183 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 GREM2Q9H772 168 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 RNF181Q9P0P0 153 aa6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MASP2O00187 686 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 PRSS23O95084 383 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 FPR1P21462 350 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 GUCY1A2P33402 732 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ALDH1A3P47895 512 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 OCA2Q04671 838 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 STAT4Q14765 748 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 PRR16Q569H4 304 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 GPR149Q86SP6 731 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.06□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SLC6A2P23975 617 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MPLP40238 635 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 PER3P56645 1201 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 TMPRSS15P98073 1019 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SEPT2Q15019 361 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 DRC7Q8IY82 874 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MYOCQ99972 504 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.05□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 A0A1B0GTW7 788 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 BRINP1O60477 761 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ESRRBO95718 433 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 MTHFD2P13995 350 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 ATP5JP18859 108 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 FGFR4P22455 802 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 CXCR5P32302 372 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SOX5P35711 763 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 GPR3P46089 330 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 SLC6A9P48067 706 aa6.04□□□□□ -1.44
SSB-211ENST00000490914 C21orf58P58505 322 aa6.04□□□□□ -1.44
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