RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	MCL1	Q07820	350 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	MGAT5	Q09328	741 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	TCIRG1	Q13488	830 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	UBE3C	Q15386	1083 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	MAN2A1	Q16706	1144 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	GAGE13	Q4V321	117 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	NME8	Q8N427	588 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	HAS1	Q92839	578 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	EVI5L	Q96CN4	794 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	GPR87	Q9BY21	358 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	ING3	Q9NXR8	418 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PUM3-204	ENST00000490444	WNT10B	O00744	389 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	ALDH1L1	O75891	902 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	ALDH1A2	O94788	518 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TOX4	O94842	621 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	CFB	P00751	764 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MTHFD2	P13995	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	PAX3	P23760	479 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	CTSS	P25774	331 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	WAS	P42768	502 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MCAM	P43121	646 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	NEK2	P51955	445 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	BPIFB4	P59827	614 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	BIRC2	Q13490	618 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	PTPN21	Q16825	1174 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444		Q6ZVL8	140 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SYNE4	Q8N205	404 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SNX33	Q8WV41	574 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TEKT5	Q96M29	485 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TCF25	Q9BQ70	676 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	PNMA2	Q9UL42	364 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	XDH	P47989	1333 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	UBE2QL1	A1L167	161 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	KLHL33	A6NCF5	533 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	FAM20B	O75063	409 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MFAP3L	O75121	409 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	NDUFS2	O75306	463 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	ABLIM3	O94929	683 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	EDNRB	P24530	442 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SLC5A3	P53794	718 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	WNT3A	P56704	352 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	NRG3	P56975	720 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MALL	Q13021	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SEPT2	Q15019	361 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MST1L	Q2TV78	715 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM240	Q5SV17	173 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	WDR78	Q5VTH9	848 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	KRT40	Q6A162	431 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	WASF1	Q92558	559 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	FATE1	Q969F0	183 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	ARL8A	Q96BM9	186 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	UIMC1	Q96RL1	719 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	GREM2	Q9H772	168 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PUM3-204	ENST00000490444	MKS1	Q9NXB0	559 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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