RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 MED4Q9NPJ6 270 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 L1RE1Q9UN81 338 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 NCANO14594 1321 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-243ENST00000488923 ASB14A6NK59 587 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 K7ERI5 159 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MAP2K7O14733 419 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ASAP2O43150 1006 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 BUB1O43683 1085 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SRGAP2O75044 1071 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 RTN2O75298 545 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 KIF4AO95239 1232 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TBC1D8O95759 1140 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ADH1CP00326 375 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 HSPA6P17066 643 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 EPHX2P34913 555 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ARL2P36404 184 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GCLMP48507 274 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PDE6CP51160 858 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 STAT5BP51692 787 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FKBP1BP68106 108 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CLDN10P78369 228 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GCNT1Q02742 428 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CYP24A1Q07973 514 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PPP3CAQ08209 521 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SNAPC2Q13487 334 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PSMD6Q15008 389 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PARP14Q460N5 1801 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MTERF2Q49AM1 385 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 WDR44Q5JSH3 913 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TREML2Q5T2D2 321 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 EMBQ6PCB8 327 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PEX26Q7Z412 305 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 KSR1Q8IVT5 923 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 IFT20Q8IY31 132 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SHC3Q92529 594 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TRIM11Q96F44 468 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CDCA5Q96FF9 252 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FNBP1Q96RU3 617 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 AGPAT1Q99943 283 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ISCUQ9H1K1 167 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ELP3Q9H9T3 547 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 POLD4Q9HCU8 107 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 RAB20Q9NX57 234 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 BTBD7Q9P203 1132 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 AMFRQ9UKV5 643 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TFR2Q9UP52 801 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ADM5C9JUS6 153 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LGR5O75473 907 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MTA2O94776 668 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GGPS1O95749 300 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MYBL1P10243 752 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 EPHB4P54760 987 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GALCP54803 685 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 VSNL1P62760 191 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GPC5P78333 572 aa7.13□□□□□ -1.27
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