RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487774.1

C7orf49-211, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C7orf49, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-211ENST00000487774 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 B4GALT5O43286 388 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 HRO43593 1189 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CCR3P51677 355 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SHC2P98077 582 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 PPP2R5CQ13362 524 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 TUSC3Q13454 348 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 RAB33AQ14088 237 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 UVSSAQ2YD98 709 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 IER2Q9BTL4 223 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 FASNP49327 2511 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MAN2B1O00754 1011 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SLC37A4O43826 429 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 NPTXRO95502 500 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CEBPBP17676 345 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 OR1D2P34982 312 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SATB1Q01826 763 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 GRM2Q14416 872 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 PPP2R5DQ14738 602 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 PARP2Q9UGN5 583 aa21.11■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 ZBTB39O15060 712 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 RHOP08100 348 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CPA1P15085 419 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 NLRP5P59047 1200 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 GAS6Q14393 721 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.1■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 M0R2N6 131 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 FNTBP49356 437 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 POU5F1BQ06416 359 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CAPSQ13938 189 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 C4orf19Q8IY42 314 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MTRQ99707 1265 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 LXNQ9BS40 222 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 BRD9Q9H8M2 597 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 IGF2RP11717 2491 aa21.09■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 A0A1B0GUA9 196 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 PTGESO14684 152 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 TM4SF5O14894 197 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CXCL12P48061 93 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 NAB2Q15742 525 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 XKR9Q5GH70 373 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 PDXDC1Q6P996 788 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 RTL10Q7L3V2 364 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 FAM3CQ92520 227 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 BRF1Q92994 677 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 RGL1Q9NZL6 768 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MTRRQ9UBK8 725 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.08■□□□□ 0.97
C7orf49-211ENST00000487774 CHRNB1P11230 501 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 IFNAR1P17181 557 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 FGD1P98174 961 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 TFDP1Q14186 410 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 IL31Q6EBC2 164 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 Q6ZUG5 572 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 FGFR3P22607 806 aa21.06■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 LIMK1P53667 647 aa21.06■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 NPY5RQ15761 445 aa21.06■□□□□ 0.96
C7orf49-211ENST00000487774 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms