RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 GABRQQ9UN88 632 aa10.37□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 USP20Q9Y2K6 914 aa10.37□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa10.37□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10.37□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.37□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC85CA6NKD9 419 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 H3BRB1 525 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 HAS3O00219 553 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EBAG9O00559 213 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EPHB6O15197 1021 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.756e-6■■■■□ 20.3
POLR1A-208ENST00000486964 MAGEB2O15479 319 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MARK3P27448 753 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 DGKDQ16760 1214 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MICALCLQ6ZW33 695 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 VPS36Q86VN1 386 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CD302Q8IX05 232 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD14AQ96MC6 490 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC1Q9BTT6 524 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PLCB1Q9NQ66 1216 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 GDF3Q9NR23 364 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 DUSP10Q9Y6W6 482 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa10.36□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 WDR81Q562E7 1941 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 AGPSO00116 658 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MSCO60682 206 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 GFPT2O94808 682 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 F2P00734 622 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EDN1P05305 212 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MYBL2P10244 700 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CYBAP13498 195 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 KLRC1P26715 233 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 FLT3LGP49771 235 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CYP2J2P51589 502 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EFNA5P52803 228 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 ADAM17P78536 824 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CUL1Q13616 776 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CLUL1Q15846 466 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CFAP58Q5T655 872 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 HGSNATQ68CP4 663 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PLEKHO2Q8TD55 490 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PBKQ96KB5 322 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 TLR10Q9BXR5 811 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 FZD8Q9H461 694 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 RNF186Q9NXI6 227 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 FBXL5Q9UKA1 691 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 TFR2Q9UP52 801 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MCM3APO60318 1980 aa10.35□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0B4J269 797 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 RRN3P2A6NIE6 340 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 K7ERI5 159 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 ABLIM1O14639 778 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EXOC3O60645 756 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF286BP0CG31 522 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 HOXC8P31273 242 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 USP8P40818 1118 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 IRAK1P51617 712 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 PTENP60484 403 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 CLDN10P78369 228 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 SP3Q02447 781 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL30Q0D2K2 578 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 BFSP1Q12934 665 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MTMR3Q13615 1198 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 EMC10Q5UCC4 262 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.34□□□□□ -0.75
POLR1A-208ENST00000486964 ZPBP2Q6X784 338 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms