RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 VRK3Q8IV63 474 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.53e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-210ENST00000485459 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 MRI1Q9BV20 369 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF185O15231 689 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 LPXNO60711 386 aa5.68□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.68□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 TEX33O43247 280 aa5.67□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 MED25Q71SY5 747 aa5.67□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 LCORLQ8N3X6 602 aa5.67□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 K7ESF4 209 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.66□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 GUCY2FP51841 1108 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZPA2 131 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 DPF2Q92785 391 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-210ENST00000485459 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF181Q9P0P0 153 aa5.65□□□□□ -1.5
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