RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482507.5

ATG4B-220, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-220ENST00000482507 NUP85Q9BW27 656 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-220ENST00000482507 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-220ENST00000482507 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-220ENST00000482507 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-220ENST00000482507 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-220ENST00000482507 CYP1A2P05177 515 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 GZMAP12544 262 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 MMP13P45452 471 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CYP1B1Q16678 543 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC121Q6ZUS5 278 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 FAM160B2Q86V87 743 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SHC3Q92529 594 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 GINM1Q9NU53 330 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 FEM1BQ9UK73 627 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 USP20Q9Y2K6 914 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 TP73O15350 636 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 PEX10O60683 326 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SLCO1A2P46721 670 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CST9Q5W186 159 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 PLA2G4FQ68DD2 849 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 HELQQ8TDG4 1101 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 OPTNQ96CV9 577 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CABS1Q96KC9 395 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.95■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 RASSF9O75901 435 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ICAM1P05362 532 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CYP11B1P15538 503 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 HSPA6P17066 643 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.149e-7■■■□□ 19.2
ATG4B-220ENST00000482507 ALCAMQ13740 583 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CLUL1Q15846 466 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 TREML2Q5T2D2 321 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CPXCR1Q8N123 301 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CENPTQ96BT3 561 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ATP9AO75110 1047 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 NCKAP1LP55160 1127 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 LPAR1Q92633 364 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ART4Q93070 314 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF653Q96CK0 615 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 PODXLO00592 558 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 PMM2O15305 246 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 RIPK2O43353 540 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SPOPO43791 374 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CCNE2O96020 404 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 GJA5P36382 358 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SMTNP53814 917 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 TRIM7Q9C029 511 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC169A6NNP5 214 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 MAPK13O15264 365 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CLDN3O15551 220 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 LYPLA2O95372 231 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 GGPS1O95749 300 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 SOX10P56693 466 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 DRP2Q13474 957 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 PLCB4Q15147 1175 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 CEP89Q96ST8 783 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 AAASQ9NRG9 546 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-220ENST00000482507 MNAT1P51948 309 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms