RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480788.1

LNPK-209, Transcript of lunapark, ER junction formation factor, human

TSL 3

Gene LNPK, Length 311 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LNPK-209	ENST00000480788	STC2	O76061	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SCNN1G	P51170	649 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	EVA1C	P58658	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SP140	Q13342	867 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	VPS72	Q15906	364 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788		Q6ZRM9	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	GABRD	O14764	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	TRIM24	O15164	1050 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	NDUFS2	O75306	463 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	PEX11B	O96011	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	RABGGTB	P53611	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	XDH	P47989	1333 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ADCY6	O43306	1168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	GPR32	O75388	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	RAP2A	P10114	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ATP5J	P18859	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	PTGS2	P35354	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SREBF1	P36956	1147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	CLRN1	P58418	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	MXRA7	P84157	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	CREM	Q03060	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788		Q6ZVL8	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	MIER2	Q8N344	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	JADE3	Q92613	823 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	DTNB	O60941	627 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	GC	P02774	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ERBB2	P04626	1255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ALAS1	P13196	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	VCAM1	P19320	739 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ADRA1B	P35368	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	WAS	P42768	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LNPK-209	ENST00000480788	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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