RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476564.5

MTERF4-215, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

TSL 2

Gene MTERF4, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-215	ENST00000476564	P4HA2	O15460	535 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SKI	P12755	728 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	KCNE1	P15382	129 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CDC25B	P30305	580 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	VAMP7	P51809	220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF75D	P51815	510 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CCL23	P55773	120 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	DLG4	P78352	724 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PPP3CA	Q08209	521 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NR1I3	Q14994	352 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SURF1	Q15526	300 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ZACN	Q401N2	412 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	USP37	Q86T82	979 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CD302	Q8IX05	232 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ADAM2	Q99965	735 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RNF19A	Q9NV58	838 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	HES2	Q9Y543	173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TRANK1	O15050	2925 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	STX10	O60499	249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	EOMES	O95936	686 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	KRT13	P13646	458 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RAG1	P15918	1043 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	FMO5	P49326	533 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	AP3M2	P53677	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NAB2	Q15742	525 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PTGES	O14684	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	EFCAB14	O75071	495 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SERPINC1	P01008	464 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NFIC	P08651	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CSF2RA	P15509	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	MXI1	P50539	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	UBASH3A	P57075	661 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	VSTM4	Q8IW00	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	HACE1	Q8IYU2	909 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms