RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	ACKR2	O00590	384 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SPTLC1	O15269	473 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	FGFR4	P22455	802 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	TXLNA	P40222	546 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	MAPK6	Q16659	721 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PIDD1	Q9HB75	910 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CLUH	O75153	1309 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CIT	O14578	2027 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A087WWV3	80 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245		H0YCG3	227 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SPTLC2	O15270	562 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	GLUD1	P00367	558 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	GALT	P07902	379 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SP9	P0CG40	484 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DDIT3	P35638	169 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CLCN4	P51793	760 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF131	P52739	623 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	GRIN1	Q05586	938 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	KANK3	Q6NY19	840 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	HACE1	Q8IYU2	909 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	RAD54L	Q92698	747 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	N4BP3	O15049	544 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CUTA	O60888	179 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	OFD1	O75665	1012 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ALDH2	P05091	517 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PLS3	P13797	630 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	PLCG1	P19174	1290 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	NPTX2	P47972	431 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP8	P85298	464 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	LMNB2	Q03252	620 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	STK38	Q15208	465 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CUEDC2	Q9H467	287 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DMD	P11532	3685 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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