RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 SOD2P04179 222 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 LTBRP36941 435 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 NUCB2P80303 420 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ALCAMQ13740 583 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 KYAT1Q16773 422 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SNX27Q96L92 541 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PANK4Q9NVE7 773 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 XIRP2A4UGR9 3374 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFRSF10AO00220 468 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 TADA2AO75478 443 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GCNT3O95395 438 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CLTAP09496 248 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 COL9A1P20849 921 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 XKR4Q5GH76 650 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1841Q6NSI8 718 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 FUT10Q6P4F1 479 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 STAMQ92783 540 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 UROC1Q96N76 676 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CD207Q9UJ71 328 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 VWA8A3KMH1 1905 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 OGTO15294 1046 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GLP2RO95838 553 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNE1P15382 129 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GLUD2P49448 558 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ASIC1P78348 528 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPN14Q15678 1187 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 NAB2Q15742 525 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CLUL1Q15846 466 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ADALQ6DHV7 355 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PPFIBP1Q86W92 1011 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CASP10Q92851 521 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MSTO1Q9BUK6 570 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM9Q9C026 710 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CNTN3Q9P232 1028 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNH3Q9ULD8 1083 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PLXNA3P51805 1871 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 F8W810 466 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 C2CD2LO14523 706 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R37O75864 691 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CMA1P23946 247 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 COASYQ13057 564 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 USP41Q3LFD5 358 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SEZ6Q53EL9 994 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR65Q8IYL9 337 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 RABGGTAQ92696 567 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ACCSQ96QU6 501 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC1BQ9P126 229 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0B4J269 797 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-205ENST00000466097 MBTPS2O43462 519 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP1-205ENST00000466097 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms