RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 NEK4P51957 841 aa24.97■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 NTHL1P78549 312 aa24.97■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.97■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 GUCY1B3Q02153 619 aa24.96■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.96■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.96■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.96■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 CDH7Q9ULB5 785 aa24.96■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 DCNP07585 359 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 LIG1P18858 919 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 NAMPTP43490 491 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ZNF174Q15697 407 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 LIN9Q5TKA1 542 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 PARM1Q6UWI2 310 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 DEPTORQ8TB45 409 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 FGF14Q92915 247 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 SIT1Q9Y3P8 196 aa24.95■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 C8AP07357 584 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 HOXA9P31269 272 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 GPC5P78333 572 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 FOXK2Q01167 660 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 SPECC1Q5M775 1068 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ERMNQ8TAM6 284 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 POLD4Q9HCU8 107 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 GDAQ9Y2T3 454 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 CACNA1AO00555 2505 aa24.94■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 CCL16O15467 120 aa24.93■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 OR52Z1P0C646 297 aa24.93■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 RAB33AQ14088 237 aa24.93■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 PDXDC1Q6P996 788 aa24.93■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 FGF13Q92913 245 aa24.93■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.93■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 DMXL1Q9Y485 3027 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 FGFR3P22607 806 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 OR1D2P34982 312 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 PPP2R5AQ15172 486 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ECM1Q16610 540 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ITFG1Q8TB96 612 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 R4GN57 208 aa24.92■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 XYLBO75191 536 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 EFNA5P52803 228 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 STARD6P59095 220 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 UVSSAQ2YD98 709 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 FOXQ1Q9C009 403 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 POLIQ9UNA4 740 aa24.91■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 B3GAT3O94766 335 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 LMNAP02545 664 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 POU2F2P09086 479 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 GLULP15104 373 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 MUTP22033 750 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 C1orf210Q8IVY1 113 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 PJA1Q8NG27 643 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 C8orf76Q96K31 380 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 IFT74Q96LB3 600 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 MTRRQ9UBK8 725 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa24.9■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 GPR179Q6PRD1 2367 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 CLCNKBP51801 687 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 UPP1Q16831 310 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 MTSS1LQ765P7 747 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 KIFAP3Q92845 792 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 SHDQ96IW2 340 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
USP4-208ENST00000464168 VWA8A3KMH1 1905 aa24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 LRRN2O75325 713 aa24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 SP9P0CG40 484 aa24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 ID4P47928 161 aa24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 TTC38Q5R3I4 469 aa24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.88■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms