RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.42□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DNM3Q9UQ16 869 aa8.42□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRIP11Q15643 1979 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VWA8A3KMH1 1905 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL4A3Q01955 1670 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NR1I2O75469 434 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADH1AP07327 375 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MUTP22033 750 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC12A3P55017 1021 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UPP1Q16831 310 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRT79Q5XKE5 535 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIFAP3Q92845 792 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IFT74Q96LB3 600 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TTPALQ9BTX7 342 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDT1Q9H211 546 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FNIP2Q9P278 1114 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USTQ9Y2C2 406 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DMDP11532 3685 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP34Q70CQ2 3546 aa8.41□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRBA1A5PL33 1030 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CARNS1A5YM72 827 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCL16O15467 120 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZMYND10O75800 440 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 B3GAT3O94766 335 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CFHP08603 1231 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLA2G4BP0C869 781 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FGFR3P22607 806 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PROZP22891 400 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 OR1D2P34982 312 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRPHP41219 470 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TDGQ13569 410 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPP2R5AQ15172 486 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PSMD5Q16401 504 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 XKR4Q5GH76 650 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPECC1Q5M775 1068 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HYIQ5T013 277 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP49Q70CQ1 688 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HACE1Q8IYU2 909 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FLCNQ8NFG4 579 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ITFG1Q8TB96 612 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.4□□□□□ -1.06
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLUHO75153 1309 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.073e-9■■■■■ 206.8
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PAPLNO95428 1278 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LAMP2P13473 410 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNFSF9P41273 254 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GRM5P41594 1212 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GUCY2FP51841 1108 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDR1P51861 262 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EFNA5P52803 228 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms