RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PALB2Q86YC2 1186 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 URGCPQ8TCY9 931 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 FAM3CQ92520 227 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 DNASE1L2Q92874 299 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 FAM227BQ96M60 508 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SCLT1Q96NL6 688 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PCYT2Q99447 389 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 FAM107BQ9H098 131 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 RIOX1Q9H6W3 641 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 DNAI1Q9UI46 699 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 POLIQ9UNA4 740 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 WDR81Q562E7 1941 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 F5P12259 2224 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 COL1A2P08123 1366 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 B4E1Z4 1266 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PIK3CDO00329 1044 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MAP2K7O14733 419 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SGSM2O43147 1006 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 HBP1O60381 514 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 LILRB3O75022 631 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 VTNP04004 478 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SOD2P04179 222 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ALDH2P05091 517 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GLUD2P49448 558 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SLC26A2P50443 739 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MTMR1Q13613 665 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 LRRC32Q14392 662 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 STX1AQ16623 288 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 LONRF3Q496Y0 759 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF605Q86T29 641 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 METTL13Q8N6R0 699 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 FGF13Q92913 245 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PIGSQ96S52 555 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SLC32A1Q9H598 525 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 BRD9Q9H8M2 597 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MED4Q9NPJ6 270 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ANO10Q9NW15 660 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 KLK13Q9UKR3 277 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 AKT3Q9Y243 479 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF213O14771 459 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 BACH1O14867 736 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MAFGO15525 162 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 XYLBO75191 536 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GPR32O75388 356 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ECI2O75521 394 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ZMYND10O75800 440 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SKIP12755 728 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PLA2G2AP14555 144 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ITGB5P18084 799 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 NTHL1P78549 312 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GRM4Q14833 912 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SEC23AQ15436 765 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms