RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 RSAD1Q9HA92 442 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 KCNJ18B7U540 433 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 KCNJ12Q14500 433 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 SNX27Q96L92 541 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 RBSNQ9H1K0 784 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 UPP2O95045 317 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 IL18RAPO95256 599 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 MLH1P40692 756 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 DEFB103AP81534 67 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 BFSP1Q12934 665 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 PSMD6Q15008 389 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 USP37Q86T82 979 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 FNBP1Q96RU3 617 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TTC26A0AVF1 554 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 LACTBL1A8MY62 500 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 FGFR1P11362 822 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF18P17022 549 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 WNT7BP56706 349 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 BORCS6Q96GS4 357 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ZFP42Q96MM3 310 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 GAD1Q99259 594 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ATP1A3P13637 1013 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 VAMP7P51809 220 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 SPAG1Q07617 926 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 SURF1Q15526 300 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ABI1Q8IZP0 508 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 HERVK_113Q902F9 699 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ARL5CA6NH57 179 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 HOXA2O43364 376 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM49P0CI25 452 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM49CP0CI26 452 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CD302Q8IX05 232 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 HELQQ8TDG4 1101 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TMC2Q8TDI7 906 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ASB7Q9H672 318 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 RNF19AQ9NV58 838 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CNTN3Q9P232 1028 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TNNI1P19237 187 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 DLG4P78352 724 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 JADE1Q6IE81 842 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 TOP1MTQ969P6 601 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 KIF12Q96FN5 646 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
HOXA4-202ENST00000428284 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 OFD1O75665 1012 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 NFICP08651 508 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 CGRRF1Q99675 332 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 GDF15Q99988 308 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms