RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SGTAO43765 313 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MYBP10242 640 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HK1P19367 917 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RAP2BP61225 183 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ATP8B2P98198 1209 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PTH1RQ03431 593 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HS1BP3Q53T59 392 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 NXNQ6DKJ4 435 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 Q6ZSN1 163 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MIEF2Q96C03 454 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PGBD4Q96DM1 585 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 C8orf49Q96NF6 230 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MRI1Q9BV20 369 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SPON1Q9HCB6 807 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.49□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 B5MCH6 92 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ATF3P18847 181 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ATP5JP18859 108 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.532e-21■□□□□ 10.6
RBM39-211ENST00000426951 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DOK3Q7L591 496 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RNF169Q8NCN4 708 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TTC8Q8TAM2 541 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 IFI44Q8TCB0 444 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 FAM89AQ96GI7 184 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TAAR9Q96RI9 348 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ADOQ96SZ5 270 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 JAG2Q9Y219 1238 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TEX33O43247 280 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ALDH2P05091 517 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MAP2K6P52564 334 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CLRN1P58418 232 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CTXN1P60606 82 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RAB39AQ14964 217 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CCDC157Q569K6 752 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PALM2Q8IXS6 379 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TFAP2CQ92754 450 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RGMAQ96B86 450 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 VSTM5A8MXK1 200 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PJA2O43164 708 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 SELENOPP49908 381 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 CREMQ03060 361 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 TLE1Q04724 770 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 CSRP2Q16527 193 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 ZNF529Q6P280 563 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 Q6ZRM9 215 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 C3orf20Q8ND61 904 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms