RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412722.1

LINC00427-201, long intergenic non-protein coding RNA 427, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00427, Length 430 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00427-201ENST00000412722 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.4□□□□□ -1.54
LINC00427-201ENST00000412722 GLI3P10071 1580 aa5.4□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 USP19O94966 1318 aa5.4□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 PHF2O75151 1096 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 TGFB1P01137 390 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 COL6A1P12109 1028 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 HSD3B1P14060 373 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ABCB4P21439 1286 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CHKAP35790 457 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 MAPKAPK2P49137 400 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 PRR5P85299 388 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ICA1Q05084 483 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF543Q08ER8 600 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 MGAT5Q09328 741 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 MAN2A1Q16706 1144 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CCDC174Q6PII3 467 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 PCGF5Q86SE9 256 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 VSIG10LQ86VR7 867 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 IL31RAQ8NI17 732 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 MYLIPQ8WY64 445 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 KIAA1191Q96A73 305 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 SLC35A4Q96G79 324 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 TDP1Q9NUW8 608 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 RPTORQ8N122 1335 aa5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 A0A087WV62 115 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 H3BUI4 141 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ADAMTS3O15072 1205 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 NCK2O43639 380 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 IL18RAPO95256 599 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 TECP42680 631 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ERVFC1P60507 584 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 BLMHQ13867 455 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 DAG1Q14118 895 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 RAB39AQ14964 217 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 SEPT2Q15019 361 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CR1LQ2VPA4 569 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 WDR78Q5VTH9 848 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 KANK2Q63ZY3 851 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 RPTNQ6XPR3 784 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 DTX3Q8N9I9 347 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 SUCLG2Q96I99 432 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 SAMD11Q96NU1 681 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 NT5C1BQ96P26 610 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ARMT1Q9H993 441 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 DLL4Q9NR61 685 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 PNPOQ9NVS9 261 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 CDC23Q9UJX2 597 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.38□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 A0A1W2PR48 441 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 POM121BA6NF01 834 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 NUDT19A8MXV4 375 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 MYO1FO00160 1098 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 SLC26A4O43511 780 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 AKR1B10O60218 316 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 TMEM127O75204 238 aa5.37□□□□□ -1.55
LINC00427-201ENST00000412722 FGF18O76093 207 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms