RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391066.1

RNU6-1000P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1000, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1000P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CDC42EP1Q00587 391 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NRN1LQ496H8 165 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TFAP2CQ92754 450 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TDP1Q9NUW8 608 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CEP72Q9P209 647 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TEX33O43247 280 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 POU2F2P09086 479 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ATP5JP18859 108 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PDCP20941 246 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 AKAP5P24588 427 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PRR18Q8N4B5 295 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 KAT5Q92993 513 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NDC1Q9BTX1 674 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PF4V1P10720 104 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 MGAT1P26572 445 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CTXN1P60606 82 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 DSC2Q02487 901 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 SYT12Q8IV01 421 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RNF169Q8NCN4 708 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 IFI44Q8TCB0 444 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RAB24Q969Q5 203 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 MYOCQ99972 504 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CDH19Q9H159 772 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 POGKQ9P215 609 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PTTG1IPP53801 180 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RAP2BP61225 183 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 FOXE3Q13461 319 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RABL3Q5HYI8 236 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 USP45Q70EL2 814 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TTC7BQ86TV6 843 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RSPH3Q86UC2 560 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZNF503Q96F45 646 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TMX3Q96JJ7 454 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1000P-201ENST00000391066 DRGXA6NNA5 263 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 LEFTY2O00292 366 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TRIM24O15164 1050 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 MATN3O15232 486 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RFPL1O75677 317 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 POMCP01189 267 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 C1SP09871 688 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NHLH2Q02577 135 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RAB39AQ14964 217 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 MIIPQ5JXC2 388 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZNF529Q6P280 563 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 GGNQ86UU5 652 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 DRC7Q8IY82 874 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 AMHP03971 560 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 TNFRSF1AP19438 455 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 DGCR2P98153 550 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 SLC25A3Q00325 362 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 DACT2Q5SW24 774 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 METRNLQ641Q3 311 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1000P-201ENST00000391066 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms