RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 LIG4P49917 911 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 DSG1Q02413 1049 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MCL1Q07820 350 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 POSTNQ15063 836 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PTPN14Q15678 1187 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 SPECC1Q5M775 1068 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CES5AQ6NT32 575 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CD302Q8IX05 232 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 GJD3Q8N144 294 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 DDX12PQ92771 950 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CHST7Q9NS84 486 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 FNIP2Q9P278 1114 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIP11Q15643 1979 aa9.3□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 K7ENM7 598 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ABLIM1O14639 778 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGESO14684 152 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 GLP2RO95838 553 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 EDN1P05305 212 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 KLRC2P26717 231 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MTHFRP42898 656 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ME1P48163 572 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 NAB2Q15742 525 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 FUT10Q6P4F1 479 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB33Q86T24 672 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX27Q96L92 541 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 TTPALQ9BTX7 342 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 TNMDQ9H2S6 317 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MARCH5Q9NX47 278 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CNTN3Q9P232 1028 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 USP20Q9Y2K6 914 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.29□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0B4J269 797 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MYMKA6NI61 221 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 OGTO15294 1046 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ALADP13716 330 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 IL9P15248 144 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP3A5P20815 502 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 OSTNP61366 133 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ZP2Q05996 745 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CLUL1Q15846 466 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 RTL10Q7L3V2 364 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 DYMQ7RTS9 669 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC15Q8TF66 581 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 SUSD6Q92537 303 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ACCSQ96QU6 501 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 PANK2Q9BZ23 570 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 S1PR5Q9H228 398 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms