RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 FUT10Q6P4F1 479 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 CASP10Q92851 521 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 BICD1Q96G01 975 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 ACAP3Q96P50 834 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 TBX20Q9UMR3 447 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 SCN1AP35498 2009 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 CLDN3O15551 220 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 LILRB3O75022 631 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 URODP06132 367 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 XKR4Q5GH76 650 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 SHC4Q6S5L8 630 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 SFR1Q86XK3 245 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 CFAP45Q9UL16 551 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 PIGRP01833 764 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 ABCD1P33897 745 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 GLUD2P49448 558 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 LIG4P49917 911 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 GTF2BQ00403 316 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 MCL1Q07820 350 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 SNX27Q96L92 541 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-201ENST00000366391 C2CD2LO14523 706 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 TADA2AO75478 443 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 KIF4AO95239 1232 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 GAP43P17677 238 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 DSG1Q02413 1049 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 E2F4Q16254 413 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SEZ6Q53EL9 994 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 HASPINQ8TF76 798 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 CD320Q9NPF0 282 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 CHST7Q9NS84 486 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNE1P15382 129 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 EPCAMP16422 314 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 ME1P48163 572 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 ZP2Q05996 745 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 USP41Q3LFD5 358 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 B3GALT6Q96L58 329 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 S1PR5Q9H228 398 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 CNTN3Q9P232 1028 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 83.5
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R37O75864 691 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 IDEP14735 1019 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 KLRC2P26717 231 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 BECN1Q14457 450 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR65Q8IYL9 337 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SUSD6Q92537 303 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 STAMQ92783 540 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 DHX58Q96C10 678 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 UROC1Q96N76 676 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 APOL5Q9BWW9 433 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 TNMDQ9H2S6 317 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 CUEDC2Q9H467 287 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms