RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCANQ96GW7 911 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKP2Q99959 881 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNNQ9UQP3 1299 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLK4Q9Y5K2 254 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AFF2P51816 1311 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RSPH10B2B2RC85 870 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM229AB2RXF0 380 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP17L10C9JJH3 530 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0QZQ0 153 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTIFO43310 598 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNQ3O43525 872 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF217O75362 1048 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RSPH10BP0C881 870 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFI30P13284 250 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAG3P18627 525 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KELP23276 732 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGRP47804 291 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC12A2P55011 1212 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C21orf58P58505 322 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLA2G7Q13093 441 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DOC2AQ14183 400 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP7Q14244 749 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIDNQ504T8 468 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM26DQ5JW98 314 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZPBP2Q6X784 338 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZPA2 131 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLCO6A1Q86UG4 719 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAX1BP1Q86VP1 789 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF511Q8NB15 262 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RORBQ92753 470 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRZBQ92765 325 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAT6Q93015 286 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC39A13Q96H72 371 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ST6GAL2Q96JF0 529 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERINC2Q96SA4 455 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBX15Q96SF7 602 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FIZ1Q96SL8 496 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP89Q96ST8 783 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF700Q9H0M5 742 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLAIN2Q9P270 581 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIT1Q9Y3P8 196 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM221AA4D161 298 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMB11A5LHX3 300 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C19orf71A6NCJ1 209 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BECN2A8MW95 431 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBR3O75828 277 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AIFM1O95831 613 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGKV1D-33P01593 117 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGKV1-33P01594 117 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FREM3P0C091 2139 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF823P16415 610 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPGP29372 298 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AXLP30530 894 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PBX3P40426 434 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MCAMP43121 646 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 METAP1P53582 386 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAGLUP54802 743 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OCA2Q04671 838 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPIRE1Q08AE8 756 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAN2A1Q16706 1144 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF750Q32MQ0 723 aa-3□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms