RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 AAK1Q2M2I8 961 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 XKR4Q5GH76 650 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 IQUBQ8NA54 791 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 HASPINQ8TF76 798 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 PANK4Q9NVE7 773 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GVL5 298 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 NCK2O43639 380 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 FAM189A1O60320 539 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 KIF4AO95239 1232 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CXCL14O95715 111 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SOD2P04179 222 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 PFKFB1P16118 471 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 TNFSF9P41273 254 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFV1P49821 464 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN14Q15678 1187 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 FUT10Q6P4F1 479 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 HPS3Q969F9 1004 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ACAP3Q96P50 834 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC1BQ9P126 229 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 KCNH3Q9ULD8 1083 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 NR1I2O75469 434 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 GCNT3O95395 438 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CXCL8P10145 99 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SCP2P22307 547 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ASIC1P78348 528 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 KCNC3Q14003 757 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ADALQ6DHV7 355 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 HVCN1Q96D96 273 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 B3GALT6Q96L58 329 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CNTN3Q9P232 1028 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 HPSEQ9Y251 543 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 IRAK3Q9Y616 596 aa16.31■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CITO14578 2027 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0B4J269 797 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 C2CD2LO14523 706 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 LILRB3O75022 631 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 IL9P15248 144 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CMA1P23946 247 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 AFMP43652 599 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 NUCB2P80303 420 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 MSTO1Q9BUK6 570 aa16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 OGTO15294 1046 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CLTAP09496 248 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 KCNE1P15382 129 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ADSSP30520 456 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 ABCD1P33897 745 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CLCNKBP51801 687 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 AMPD3Q01432 767 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 SPAG1Q07617 926 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CUL4BQ13620 913 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms