RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 TMEM105Q8N8V8 129 aa24.98■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.98■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.98■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.98■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.98■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 HIP1RO75146 1068 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 ZMYND10O75800 440 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 CDC25AP30304 524 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 NPTX2P47972 431 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 PSMD5Q16401 504 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 MCTP1Q6DN14 999 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 DAW1Q8N136 415 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 MYADMQ96S97 322 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.97■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 ST18O60284 1047 aa24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 PDXDC1Q6P996 788 aa24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 DRC1Q96MC2 740 aa24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.96■■□□□ 1.59
CLTB-202ENST00000345807 H0Y858 1186 aa24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CLCN5P51795 746 aa24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 FBXL21Q9UKT6 434 aa24.95■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CLCNKBP51801 687 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 MAPK7Q13164 816 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 KCNK18Q7Z418 384 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CEP120Q8N960 986 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 FLCNQ8NFG4 579 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CDT1Q9H211 546 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.94■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 ADAM12O43184 909 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 B3GAT3O94766 335 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 GRM5P41594 1212 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 LIN9Q5TKA1 542 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 UROC1Q96N76 676 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 VWA8A3KMH1 1905 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 FGFR3P22607 806 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 OSTNP61366 133 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 UPP1Q16831 310 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 SIX5Q8N196 739 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 NXPE3Q969Y0 559 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TMX3Q96JJ7 454 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TIPINQ9BVW5 301 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.92■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 SLC16A4O15374 487 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 C8AP07357 584 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 LAMP2P13473 410 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 NPR3P17342 541 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 GJB2P29033 226 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TRIP11Q15643 1979 aa24.91■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 SFI1A8K8P3 1242 aa24.9■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 H3BQV1 296 aa24.9■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 TRAPPC3O43617 180 aa24.9■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 CFHP08603 1231 aa24.9■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 MCF2P10911 925 aa24.9■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 FSHRP23945 695 aa24.9■■□□□ 1.58
CLTB-202ENST00000345807 GUCY2CP25092 1073 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms