RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 MYO1CO00159 1063 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 DCTN3O75935 186 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GIT2Q14161 759 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 OPHN1O60890 802 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 COMTP21964 271 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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NISCH-201ENST00000345716 LRRC14Q15048 493 aa21.96■■□□□ 1.11
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NISCH-201ENST00000345716 RAD51CO43502 376 aa21.95■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 LRGUKQ96M69 825 aa21.95■■□□□ 1.11
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NISCH-201ENST00000345716 Q9H521 79 aa21.95■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TMX2Q9Y320 296 aa21.95■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 EXTL3O43909 919 aa21.95■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.95■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 PIK3R2O00459 728 aa21.95■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.94■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.94■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 A0A087X0T9 212 aa21.94■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 USP38Q8NB14 1042 aa21.94■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 AP1B1Q10567 949 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 FIGNQ5HY92 759 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.93■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 MCEEQ96PE7 176 aa21.93■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 EPC2Q52LR7 807 aa21.93■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 CASP4P49662 377 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.93■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.93■■□□□ 1.1
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NISCH-201ENST00000345716 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 APOL1O14791 398 aa21.92■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 HIF1AQ16665 826 aa21.92■■□□□ 1.1
NISCH-201ENST00000345716 IER5Q5VY09 327 aa21.92■■□□□ 1.1
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