RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 EXTL3O43909 919 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 TADA2AO75478 443 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 IL1R1P14778 569 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NPEPPSP55786 919 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ART3Q13508 389 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NR1I3Q14994 352 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 GNASQ5JWF2 1037 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PPM1NQ8N819 430 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 GBP5Q96PP8 586 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 TMX2Q9Y320 296 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK13O15264 365 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGA4P13612 1032 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PDGFRAP16234 1089 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 GALCP54803 685 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 FRA10AC1Q70Z53 315 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC8Q8TAM2 541 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SLIT1O75093 1534 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXP2O15409 715 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DRAP01903 254 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PCSK1P29120 753 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTR2P61160 394 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 EXT2Q93063 718 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 MMEP08473 750 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIK1P39086 918 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAMEP78395 509 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF235Q14590 738 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SNCBQ16143 134 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 CNPY4Q8N129 248 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NT5C1AQ9BXI3 368 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS11Q9H270 941 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX12Q9UMY4 172 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 RCOR2Q8IZ40 523 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA4Q8NEY3 305 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ATL2Q8NHH9 583 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINI1Q99574 410 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 CHP1Q99653 195 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 EHD2Q9NZN4 543 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SUN2Q9UH99 717 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NOP14P78316 857 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 MTF1Q14872 753 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 IZUMO3Q5VZ72 239 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PID1Q7Z2X4 250 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNRD3Q86VQ6 643 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC71Q8N4P6 559 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ASIC4Q96FT7 647 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 FGD4Q96M96 766 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 SALL1Q9NSC2 1324 aa17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX2O60749 519 aa17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TPI1P60174 286 aa17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.27■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SV2CQ496J9 727 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM83AQ86UY5 434 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf54Q8WWF1 131 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 MROH8Q9H579 483 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 MRFAP1Q9Y605 127 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 DCTN3O75935 186 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SREBF1P36956 1147 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 NOTUMQ6P988 496 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB18Q99592 522 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FHOD1Q9Y613 1164 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ESYT3A0FGR9 886 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 OPHN1O60890 802 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 COPS2P61201 443 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCL9Q07325 125 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TNS2Q63HR2 1409 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQJ5 194 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 USP27XA6NNY8 438 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 GNGT2O14610 69 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms