RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 NBPF15Q8N660 670 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 OTULINQ96BN8 352 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 FAM161BQ96MY7 647 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 RTN2O75298 545 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 RFFLQ8WZ73 363 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 ECT2Q9H8V3 914 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 CEP70Q8NHQ1 597 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 GFAPP14136 432 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 E2F4Q16254 413 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 TLR2O60603 784 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRM-201ENST00000332175 PDXKO00764 312 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
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