RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327284.12

SENP6-201, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SENP6, Length 2,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-201ENST00000327284 MAPK4P31152 587 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ACOT2P49753 483 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 C4orf19Q8IY42 314 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.36■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SMTNP53814 917 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PXMP2Q9NR77 195 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 WDR64B1ANS9 1081 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PLA2G6O60733 806 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 AAASQ9NRG9 546 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 RASGRF2O14827 1237 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ECEL1O95672 775 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SCP2P22307 547 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 CXCL9Q07325 125 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 CYP24A1Q07973 514 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ALCAMQ13740 583 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PPP2R5EQ16537 467 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 USTQ9Y2C2 406 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PODXLO00592 558 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PEX10O60683 326 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ART4Q93070 314 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 TBK1Q9UHD2 729 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PAEPP09466 180 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 MMP13P45452 471 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 KYNUQ16719 465 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 TTLL6Q8N841 843 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PASKQ96RG2 1323 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 GPC3P51654 580 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP6-201ENST00000327284 PTPRJQ12913 1337 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 CALCOCO2Q13137 446 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 NLRX1Q86UT6 975 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 PGM2Q96G03 612 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 TBC1D12O60347 775 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 LYPLA2O95372 231 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 TNNI1P19237 187 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 MTERF2Q49AM1 385 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 TMEM143Q96AN5 459 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 MTA2O94776 668 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 RNF146Q9NTX7 359 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP6-201ENST00000327284 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms