RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 PDE6CP51160 858 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 BIRC3Q13489 604 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PPP2R5EQ16537 467 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 LLGL2Q6P1M3 1020 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TAS1R3Q7RTX0 852 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CAND2O75155 1236 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 RARAP10276 462 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 KCNA2P16389 499 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CCND2P30279 289 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CHRNA3P32297 505 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 WNT7BP56706 349 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SEL1L2Q5TEA6 688 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 JDP2Q8WYK2 163 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF516Q92618 1163 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 FBXL18Q96ME1 805 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 WNT8AQ9H1J5 351 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PARP14Q460N5 1801 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PMS2P54278 862 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PPP2R2AP63151 447 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 HACL1Q9UJ83 578 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17.54■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TNFAIP1Q13829 316 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 AGBL2Q5U5Z8 902 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CHADLQ6NUI6 762 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CYFIP1Q7L576 1253 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 OTUD6AQ7L8S5 288 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 KIFAP3Q92845 792 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 BICD1Q96G01 975 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PCYOX1Q9UHG3 505 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 GTF3C4Q9UKN8 822 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SMIM23A6NLE4 172 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 PAX7P23759 505 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 HMGCS2P54868 508 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 BACE1P56817 501 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 GPD1LQ8N335 351 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 MDM1Q8TC05 714 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 TMC2Q8TDI7 906 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 VPS33BQ9H267 617 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 SEMA4AQ9H3S1 761 aa17.53■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 ARID2Q68CP9 1835 aa17.52■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa17.52■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.52■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 ACAD10Q6JQN1 1059 aa17.52■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.52■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 RASAL2Q9UJF2 1139 aa17.52■□□□□ 0.4
SHQ1-201ENST00000325599 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 TLDC2A0PJX2 215 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN3O15551 220 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 DRG2P55039 364 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SLC29A2Q14542 456 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 MICALL2Q8IY33 904 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 REPS2Q8NFH8 660 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 GPRASP2Q96D09 838 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PDLIM7Q9NR12 457 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 RLFQ13129 1914 aa17.52■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 FAM107AO95990 144 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 COILP38432 576 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PRKCEQ02156 737 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 MTERF2Q49AM1 385 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SPOPLQ6IQ16 392 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SAMD3Q8N6K7 520 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf54Q8WWF1 131 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ATP6V0A1Q93050 837 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 HVCN1Q96D96 273 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 TAOK3Q9H2K8 898 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PNMA2Q9UL42 364 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 HSPA6P17066 643 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ACOT2P49753 483 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ACTR2P61160 394 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 CLUL1Q15846 466 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 CYP26B1Q9NR63 512 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 PIM2Q9P1W9 311 aa17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 FGFR4P22455 802 aa17.5■□□□□ 0.39
SHQ1-201ENST00000325599 RWDD2BP57060 319 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms