RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 NOL4O94818 638 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 GRM5P41594 1212 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 AP3M2P53677 418 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBED6P86452 979 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 EPC2Q52LR7 807 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ACAP3Q96P50 834 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRJQ12913 1337 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ACTN1P12814 892 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 USP38Q8NB14 1042 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 GANQ9H2C0 597 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SQORQ9Y6N5 450 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 GHRP10912 638 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 UCHL3P15374 230 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 APBA1Q02410 837 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 PAK2Q13177 524 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ZACNQ401N2 412 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF516Q92618 1163 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SIX2Q9NPC8 291 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CHST12Q9NRB3 414 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.43■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CD4P01730 458 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 BIRC3Q13489 604 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 LPIN1Q14693 890 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 LMO3Q8TAP4 145 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC7Q99615 494 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ASB7Q9H672 318 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.42■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CCZ1BP86790 482 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 BFSP2Q13515 415 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SKILP12757 684 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CD52P31358 61 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 UBXN11Q5T124 520 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB20Q9NX57 234 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 PADI3Q9ULW8 664 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.41■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 COL6A1P12109 1028 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 RFX1P22670 979 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 RRAGAQ7L523 313 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CD302Q8IX05 232 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 BAP1Q92560 729 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM84AQ96KN4 292 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TMX1Q9H3N1 280 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SNTG2Q9NY99 539 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 LACTBL1A8MY62 500 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 SELPP16109 830 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3CAP42336 1068 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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