RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297265.4

CHMP4C-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4C, Length 1,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4C-201ENST00000297265 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 EHD2Q9NZN4 543 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 H3BRB1 525 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 HLA-DRAP01903 254 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 TMEM253P0C7T8 217 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CYP11B1P15538 503 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 FMO1Q01740 532 aa14.65□□□□□ -0.06
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CHMP4C-201ENST00000297265 ZBTB33Q86T24 672 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 METTL13Q8N6R0 699 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 NLRP4Q96MN2 994 aa14.65□□□□□ -0.06
CHMP4C-201ENST00000297265 CGRRF1Q99675 332 aa14.65□□□□□ -0.06
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CHMP4C-201ENST00000297265 THAP2Q9H0W7 228 aa14.65□□□□□ -0.06
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CHMP4C-201ENST00000297265 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.64□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 FAM170AA1A519 330 aa14.64□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 ANKRD62A6NC57 917 aa14.64□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 ASAP2O43150 1006 aa14.64□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 MMP3P08254 477 aa14.64□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 MMEP08473 750 aa14.64□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 IGBP1P78318 339 aa14.64□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 POU5F1BQ06416 359 aa14.64□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.64□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.64□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 COG5Q9UP83 839 aa14.64□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 ANK1P16157 1881 aa14.64□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 OGTO15294 1046 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 ABCB4P21439 1286 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 CHADLQ6NUI6 762 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 C17orf99Q6UX52 265 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 TSKSQ9UJT2 592 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 GZMAP12544 262 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 TCEAL1Q15170 157 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 TAF3Q5VWG9 929 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 CEP120Q8N960 986 aa14.63□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 RFFLQ8WZ73 363 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 A0A087WZ62 844 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 MAGEB2O15479 319 aa14.62□□□□□ -0.07
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CHMP4C-201ENST00000297265 CDR2Q01850 454 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 MAP2K5Q13163 448 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 GRM1Q13255 1194 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 TFDP1Q14186 410 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 FAM187BQ17R55 369 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 TMEM192Q8IY95 271 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP4C-201ENST00000297265 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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