RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 CETPP11597 493 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 LAMC2Q13753 1193 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 KRT80Q6KB66 452 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 APPL2Q8NEU8 664 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC138Q96M89 665 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TTC26A0AVF1 554 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 GFAPP14136 432 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 HDAC4P56524 1084 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00523Q86TU6 105 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM260Q9NX78 707 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SLC2A3P11169 496 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SAT1P21673 171 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ARFIP2P53365 341 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 NLRP14Q86W24 1093 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SPDL1Q96EA4 605 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CYBBP04839 570 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 POTEAQ6S8J7 498 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF18P17022 549 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 GCKP35557 465 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CPT1AP50416 773 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SREBF2Q12772 1141 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 EMC2Q15006 297 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 RASIP1Q5U651 963 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ANO5Q75V66 913 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TEX9Q8N6V9 391 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 POTEFA5A3E0 1075 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 GYG2O15488 501 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 POTEIP0CG38 1075 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 MAP3K10Q02779 954 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PDK1Q15118 436 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TERF2Q15554 542 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 POTEGQ6S5H5 508 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 C16orf89Q6UX73 402 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 C18orf8Q96DM3 657 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 GMCL1Q96IK5 515 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 FAR2Q96K12 515 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 HOXA2O43364 376 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SORBS3O60504 671 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PCSK1P29120 753 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ATICP31939 592 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 IFNAR2P48551 515 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CYP27A1Q02318 531 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TMC2Q8TDI7 906 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 C3P01024 1663 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 A8MXQ7 604 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 KLHL2O95198 593 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PYGLP06737 847 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 HIF1AQ16665 826 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 STKLD1Q8NE28 680 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 MAML1Q92585 1016 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF197O14709 1029 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 RASA1P20936 1047 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 CNTFP26441 200 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 OAZ1P54368 228 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 TGFB2P61812 414 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-201ENST00000261266 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms