RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 GGCXP38435 758 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRE-201ENST00000254667 ATG4CQ96DT6 458 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 SENP2Q9HC62 589 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRE-201ENST00000254667 PPFIA2O75334 1257 aa20.02■□□□□ 0.8
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