RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF3Q9NR23 364 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 BCAS4Q8TDM0 211 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TLR10Q9BXR5 811 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP72Q9P209 647 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PITPNM1O00562 1244 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RPA1P27694 616 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCN3P51790 818 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 GNGT1P63211 74 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL13Q8N6R0 699 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC7Q8WUI4 952 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R16BQ96T49 567 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CES2O00748 559 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 GNA14O95837 355 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPING1P05155 500 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 BFSP2Q13515 415 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX29Q8TEQ0 813 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP26B1Q9NR63 512 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 COL1A2P08123 1366 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA1P02708 482 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CCT5P48643 541 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 GRB10Q13322 594 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP170P1Q96L14 293 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SELPP16109 830 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC55Q6ZSA7 311 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 WHAMMQ8TF30 809 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB9Q96C00 473 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TUFT1Q9NNX1 390 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM169AQ9Y6X4 670 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MYMKA6NI61 221 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NBNO60934 754 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 FPGSQ05932 587 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 EHHADHQ08426 723 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 XKR9Q5GH70 373 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB12Q6NXP0 572 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK18Q7Z418 384 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP63Q96MT8 703 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PRO3102Q9H379 93 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CDHR5Q9HBB8 845 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1024Q9UPX6 916 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHB6O15197 1021 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPLA2O95372 231 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 VTNP04004 478 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ERMNQ8TAM6 284 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NEK9Q8TD19 979 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD54LQ92698 747 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 YY1AP1Q9H869 796 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SIP14410 1827 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A4O43511 780 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ERLIN2O94905 339 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TCTN1Q2MV58 587 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SFMBT2Q5VUG0 894 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 HGSNATQ68CP4 663 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM7AQ6ZMT4 941 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCKQ8N0W5 287 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM199Q8N511 208 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01465Q8N7H1 131 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF2KMTQ96G04 330 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 DRC1Q96MC2 740 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID2Q68CP9 1835 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPH10BP0C881 870 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 USP8P40818 1118 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NAB2Q15742 525 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP58Q5T655 872 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA5Q96PV4 448 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH23Q9H251 3354 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RARRES1P49788 294 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf76Q5T2E6 689 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MICALCLQ6ZW33 695 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 BTNL10A8MVZ5 291 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 E9PMD0 336 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms