RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 THP07101 528 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ALCAMQ13740 583 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 OGTO15294 1046 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 ADRB2P07550 413 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 DPYDQ12882 1025 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 TUSC3Q13454 348 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 RABGGTAQ92696 567 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 TLR9Q9NR96 1032 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 CNTN3Q9P232 1028 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYF2-201ENST00000236273 BRWD1Q9NSI6 2320 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CSPG5O95196 566 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 MYL1P05976 194 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CLTAP09496 248 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 KCNE1P15382 129 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 OR1G1P47890 313 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 KRT17Q04695 432 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TTC26A0AVF1 554 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CARNS1A5YM72 827 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CXCL8P10145 99 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 STK4Q13043 487 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM169Q96HH4 297 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 COL19A1Q14993 1142 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ZBP1Q9H171 429 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM206Q9H813 350 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TGFB1I1O43294 461 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 NR1I2O75469 434 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ACOT2P49753 483 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 HYAL1Q12794 435 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB6Q15916 424 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 VPS52Q8N1B4 723 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 ANK1P16157 1881 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 HIDE1A8MVS5 230 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 LACTBL1A8MY62 500 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 GARTP22102 1010 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 KYAT1Q16773 422 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TCF25Q9BQ70 676 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 LILRB3O75022 631 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 SPAG1Q07617 926 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PSMD2Q13200 908 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 POSTNQ15063 836 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 TIGD1Q96MW7 591 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-201ENST00000236273 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms