RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Casp14O89094 257 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Casp4P70343 373 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SpoplQ2M2N2 392 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb17Q60821 794 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CbarpQ66L44 698 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RbakQ8BQC8 711 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxl5Q8C2S5 690 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlr9Q9EQU3 1032 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk11Q9WTK7 436 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nup62clA2AG10 272 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rfx8D3YU81 596 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr95D3Z7A8 784 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mfsd14aP70187 490 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igsf9Q05BQ1 1179 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stxbp2Q64324 593 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plk4Q64702 925 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C2cd2lQ80X80 706 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pnma1Q8C1C8 353 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc18a1Q8R090 521 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spc24Q9D083 201 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PrameQ9D4Z5 464 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pds5aQ6A026 1332 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfy1P10925 782 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhox5P52651 210 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oog4Q4G0C7 502 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taok1Q5F2E8 1001 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q80WR5 230 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc50Q810U5 305 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc169Q8BXX9 214 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rsad2Q8CBB9 362 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hars2Q99KK9 505 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q99KU6 348 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GrapQ9CX99 217 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prss23Q9D6X6 382 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 March10E9PX79 788 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb6eI7HJI3 429 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Casp8O89110 480 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krt19P19001 403 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stmn4P63042 189 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tshz2Q68FE9 1030 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9DA42 136 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cntn6Q9JMB8 1028 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ecel1Q9JMI0 775 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx1Q9WV80 522 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tll2Q9WVM6 1012 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mmrn2A6H6E2 943 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnk16G5E845 292 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Diaph2O70566 1098 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aff1O88573 1216 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ephb2P54763 986 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tarbp2P97473 365 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pih1d3Q3KNI6 218 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rmdn3Q3UJU9 470 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adat2Q6P6J0 191 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Senp6Q6P7W0 1132 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr156Q6PCP7 798 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp341Q6PGC9 846 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp120Q8BZW4 436 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AdigQ8R400 80 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1502Q8VG66 316 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf25Q9QZR0 456 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mical3Q8CJ19 1993 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr161B2RPY5 545 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UrosP51163 265 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smarcad1Q04692 1021 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klra7Q60654 280 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbc1d1Q60949 1255 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zcwpw1Q6IR42 630 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EtnpplQ8BWU8 499 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prss51A0A286YDY8 319 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psmc5P62196 406 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam193bQ3U2K0 892 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmc8Q7TN58 722 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NcaldQ91X97 193 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fem1bQ9Z2G0 627 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm4758L7N258 96 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nrg3O35181 713 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnfrsf18O35714 228 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tulp2P46686 562 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrn4P59383 733 aa18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rps6P62754 249 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.1 ms