RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	SHR5	P41912	237 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	AIF1	P52923	378 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YGR151C	P53287	111 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	CYT2	Q00873	224 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	STD1	Q02794	444 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	TPO3	Q06451	622 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		6.06	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	HIP1	P06775	603 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ERD2	P18414	219 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SNF5	P18480	905 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ANB1	P19211	157 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	LSB5	P25369	354 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	URK1	P27515	501 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SEC17	P32602	292 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	THI2	P38141	450 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ARP1	P38696	384 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SSN3	P39073	555 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	FLX1	P40464	311 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	PAU15	P40585	124 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	TAX4	P47030	604 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	AIM25	P47140	327 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SKP1	P52286	194 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SDT1	P53078	280 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YGR066C	P53242	292 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YIP3	P53633	176 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	TIM8	P57744	87 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	RSM23	Q01163	450 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YPL080C	Q02826	108 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YDR391C	Q04170	232 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	VBA1	Q04301	562 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	NAT4	Q04751	285 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	RRG8	Q06109	277 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	PIN3	Q06449	215 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	PAM18	Q07914	168 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	CRT10	Q08226	957 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YOR029W	Q12243	111 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ATG5	Q12380	294 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	EAF3	Q12432	401 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	RDI1	Q12434	202 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	MOT1	P32333	1867 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	UBR1	P19812	1950 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	RIF1	P29539	1916 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	KIN82	P25341	720 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	PEX34	P25584	144 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	STP22	P25604	385 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YCR099C	P25657	155 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SFC1	P33303	322 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	TIP20	P33891	701 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	FRE2	P36033	711 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	PRY2	P36110	329 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	RIB1	P38066	345 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SPL2	P38839	148 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YIL067C	P40514	678 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	PMT6	P42934	759 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	MOB2	P43563	287 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	PTR3	P43606	678 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	BIT61	P47041	543 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	TAH11	P47112	604 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YGL235W	P53071	178 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	MDM34	P53083	459 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	CAB5	Q03941	241 aa		6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	TIM9	O74700	87 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YEF1	P32622	495 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	COX13	P32799	129 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	BCS1	P32839	456 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	DRE2	P36152	348 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	LDB7	P38210	180 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YPC1	P38298	316 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YHR122W	P38829	231 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	BDH1	P39714	382 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SPO73	P40031	143 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SYS1	P41544	203 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	YFL040W	P43562	540 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	MIC26	P50087	233 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	IPK1	Q06667	281 aa		6.03	□□□□□ -1.44
HMS2	YJR147W	RXT3	Q07458	294 aa		6.03	□□□□□ -1.44

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