RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 EFCAB14O75071 495 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ADRB2P07550 413 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 STAG3L1P0CL83 205 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF18P17022 549 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ACOT2P49753 483 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM189BP81408 668 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ENPEPQ07075 957 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 SPAG1Q07617 926 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 IKBKEQ14164 716 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 TCTN1Q2MV58 587 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 KCNJ18B7U540 433 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ENPP3O14638 875 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 BAIAP3O94812 1187 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ACTN1P12814 892 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 KRT13P13646 458 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 SYN1P17600 705 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 TNFSF9P41273 254 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 CYP24A1Q07973 514 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 KCNJ12Q14500 433 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 SEZ6Q53EL9 994 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 USP37Q86T82 979 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 PGBD4Q96DM1 585 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 BORCS6Q96GS4 357 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ACAP3Q96P50 834 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 SNTG2Q9NY99 539 aa14.54□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RECQL4O94761 1208 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 IL18RAPO95256 599 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 EOMESO95936 686 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ITGA4P13612 1032 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 OSTNP61366 133 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 PSMD6Q15008 389 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 SURF1Q15526 300 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 CD302Q8IX05 232 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM192Q8IY95 271 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 RDH13Q8NBN7 331 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 TMC2Q8TDI7 906 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 SNX27Q96L92 541 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 HES2Q9Y543 173 aa14.53□□□□□ -0.08
CHRNA4-216ENST00000636652 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CXCL8P10145 99 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ACRP10323 421 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 VAMP7P51809 220 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 BFSP1Q12934 665 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 APOL6Q9BWW8 343 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ASB7Q9H672 318 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PARP2Q9UGN5 583 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LTBP2Q14767 1821 aa14.52□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TTC26A0AVF1 554 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 FGBP02675 491 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ATP1A3P13637 1013 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 AKAP5P24588 427 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MAN2A1Q16706 1144 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 UVSSAQ2YD98 709 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 XKR4Q5GH76 650 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms